市町村保健センターとは、高齢者保健（高齢者の健康保持と医療の確保など）・母子保健（母子の健康保持・増進など）を実施する拠点です。

具体的には、地域住民に対して健康相談、保健指導、健康診査、その他の対人保険サービスなどを提供します。

保健所と市町村保健センターは地域保健法によって設置されており、保健所は都道府県や政令指定などより広範囲に向けて、感染症予防などの専門的な業務を行っています。

そのため、保健所と市町村保健センターは地域内の保険、医療、福祉に関わる施設をお互いに連携し合えるようにすることが求められています。

また、保健所の所長は医師である必要がありますが、市町村保健センターのセンター長は医師である必要はありません。